يعتبر المركز واحدا من الصروح العلمية والبحثية الرائدة في مجال التاريخ الطبيعي حيث تأسس في 2/5/1946في منطقة العيواضية وفي عام 1973 وعلى اثر ازدياد موجوداته وتطوره انتقل الى مكانه الحالي في منطقة باب المعظم وبذلك فهو يعتبر من اعرق مراكز جامعة بغداد والمركز التعليمية في العراق و يهدف إلى جمع وتصنيف وحفظ وصيانة المجاميع من النماذج العراقية الحيوانية والنباتية والجيولوجية لاستخدامها للإغراض العلمية وإجراء البحوث في مجال التاريخ الطبيعي وبالتالي فهو يعد خزينا للإرث العلمي لما يمتلكه من اّلاف الأنواع من النماذج المتنوعة التي حصل عليها المركز طوال عشرات السنين . وتعرض هذه النماذج بشكل يحاكي البيئة الطبيعية اضافة لهذا فأن المركز يقدم خدمات لرفد العملية التعليمية منها ، إقامة دورات متخصصة في مواضيع التنوع الإحيائي وتلوث البيئة والتحنيط وتحضير النماذج كما يقيم ندوات ثقافية بشأن مواضيع محددة في مجال التاريخ الطبيعي ، كما يعد المركز مرجعا للتشخيص لكل الجامعات العراقية فأي طالب يريد العمل على مجموعة إحيائية معينة فأنه لا يستطيع تشخيص الأنواع من دون الرجوع إلى المركز لتثبت التشخيص وضمن التوجهات الحديثة للمتاحف في العالم يقوم المركز بأجراء الدراسات الميدانية عن واقع التنوع الإحيائي والجيولوجي والتراث الطبيعي والمخاطر التي تهددها في إنحاء العراق واقتراح البرامج والمشاريع العلمية التي تشجع على خلق واستمرار تنمية مستدامة تساهم في تطوير الثروة الوطنية .
